Роспотребнадзор: Более 40 тыс. геномных последовательностей загружено в базу данных мутаций коронавируса
В национальной базе данных в России содержится информация о более 40 тыс. геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2, эти сведения позволяют отслеживать появление новых геновариантов, контролировать их распространение и делать прогнозы на будущее. Об этом сообщается на сайте Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор).
«На 17 ноября 2021 года в национальную базу данных загружено 40 тыс. 383 геномные последовательности вируса SARS-CoV-2, в том числе более 19 тыс. полногеномных последовательностей и свыше 21 тыс. фрагментов генома S-белка (участок, позволяющий определять наиболее важные мутации). Для сравнения, в международную базу данных GISAID загружено только 9,5 тыс. полных геномов SARS-CoV-2 из России», - говорится в сообщении.
Уточняется, что национальная база данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2 была зарегистрирована в России в начале июня 2021 года. Разработчиком программы и консолидирующим центром стал Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора. Регулярное пополнение базы позволяет вести обширный мониторинг эпидемиологической ситуации в стране, отслеживать появление новых геновариантов, контролировать их распространение и делать прогнозы на будущее. Кроме того, данные, загруженные российской стороной в международную базу GISAID, служат основой для изучения геновариантов, циркулирующих в стране, для ученых всего мира.
Как отмечается, также сотрудниками ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора был разработан алгоритм PARuS для анализа геномных последовательностей SARS-CoV-2. Разработанный алгоритм предназначен для коррекции и валидации результатов анализа, полученных с помощью международных классификаторов. В частности, применяемый во всем мире для классификации SARS-CoV-2 классификатор Pangolin в последнее время отличается нестабильностью в работе, это периодически приводит к ошибочной интерпретации данных секвенирования. PARuS позволяет производить классификацию по фрагменту S-белка, содержащему информацию о ключевых мутациях, характерных для генетических вариантов SARS-CoV-2, которые, согласно ВОЗ, подлежат специальному мониторингу.
